甲基化分析解决法医难题-彩客app

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甲基化分析解决法医难题
文章来源:上海沪峰化工有限公司   添加时间:2015/5/15 8:37:58 点击率:3618

电视剧和电影总是喜欢在“邪恶双生子(evil twin)”上大做文章。的确,外形和dna都高度相似的两个人是很难分辨的。而且这并不完全是编剧们“脑洞大开”的结果,在美国波士顿就有一个这样的强奸案,相关机构花十万美金进行二代测序才排除了嫌犯双胞胎兄弟的嫌疑。

双胞胎来自于同一个受精卵,他们的dna序列在理论上是完全相同的。不过dna复制会出现错误,个体发育过程中也会出现其他突变。如果鉴定了双胞胎之间的突变差异,就可以在犯罪现场的样本中寻找相应的突变,不过通过全基因组测序来分辨双胞胎,成本是相当高的。

dna甲基化是一种重要的表观遗传学改变,会受到环境因素的影响。研究人员利用这一点,开发了在同卵双胞胎中检测dna甲基化差异的方法。

这个方法将重亚硫酸盐处理(将未甲基化的胞嘧啶转变为尿嘧啶)与高分辨率熔解曲线分析(hrma)结合起来,成本低而且速度快。在重亚硫酸盐处理之后进行pcr扩增,可以将三个氢键的gc转变为两个氢键的at,减少双链dna的结合强度。

在五对同卵双胞胎中进行了测试,通过口腔拭子收集了他们的dna样本。研究显示,alu-e2f3基因座的熔解曲线可以区分所有双胞胎,而alu-sp基因座的熔解曲线只能分辨四对同卵双胞胎。这说明基因座的选择是进行有效分析的关键。研究人员还发现,年纪大的一对双胞胎,熔解温度的差异也大。

随着时间的推移环境能够影响dna甲基化,这是整个研究的基础。但如果需要比较多年前收集的样本与现在的样本,甲基化分析就会遇到障碍,难以用于过去的案件。值得注意的是,同一个人的不同体液有着不一样的dna甲基化模式,需要比较同样来源的体液。

尽管还存在一定的局限,hrma代表着法医学的一个重要里程碑。

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